空军军医大学学员的分配主要遵循以下原则：
综合评定：
学员毕业前会进行综合素质评定，这个评定包括文化课程、军事训练、学科竞赛、立功受奖、参加大项活动以及平时综合表现等情况。评定结果将作为确定分配工作单位的主要依据。
分配原则：
毕业学员依据综合评定排名顺序，在本专业分配计划明确的分配单位范围内，依次提出个人分配志愿。分配政策制度、综合素质评定结果、分配计划方案等全程公开公示。
分配去向：
空军军医大学学员毕业后，主要分配去向是空军、战略支援部队和联勤保障部队的医疗卫生岗位。
待遇：
学员本科毕业后，授予少尉军衔成为军官，待遇级别定为十八级，享受基本工资、各类津贴补贴、住房补助以及其他福利待遇。长期服役还可分配由全军统一建设的安置住房。
服役与培养：
军队医学院校毕业学员，取得毕业证书后，按照军队内部分配安置，先去军队基层连队进行服役，当然，军队医院上班也属于服役。服役满一定年限后，根据当事人所学专业及医术方面的成就，可以转入军队地方医院进行培养。
提前批次与普通批次：
空军军医大学的招生分为提前批次和普通批次。提前批次的招生通常与军队需求紧密结合，毕业后往往能够享受包分配的待遇，直接进入军队系统工作。而普通批次的毕业生则需要自己寻找工作机会，但他们在军队文职人员、科研机构等方面的就业机会也相对较多。
综上所述，空军军医大学学员的分配主要依据个人综合评定结果，分配去向主要是空军、战略支援部队和联勤保障部队的医疗卫生岗位，享受相应的待遇和福利。提前批次的毕业生通常能够直接获得分配，而普通批次的毕业生则需要通过个人努力和竞争。