学校自主采购手续的办理流程如下：
立项环节
各部门根据采购需求提出采购申请，提交资产处审批。
审批时需具备校内批文、资金来源确认表等资料。
资产处审批后，按批准的采购方式执行采购。
申请与批准
业务部门向学校校长室提出申请，经校长办公会或行政办公会批准。
货物类和服务类3万元（含）以上，工程维修类5万元（含）以上需向教体局提交申请并通过。
凭有关批示向采购小组提交采购申请单。
采购方式
采购小组可进行自行采购，采用书面形式编制采购询价单或竞争性谈判文件。
向不少于三家供应商发出采购询价单或竞争性谈判文件。
合同签订
公告期结束后，与中标供应商签订合同。
签订合同时需办理法人授权委托书，并将合同递交法律顾问进行审查。
验收
项目执行结束后，由项目实施部门自行组织部门验收。
进行校级验收及送交审计相关工作，按学校有关要求递交审计处进行。
资产入库
货物类资产须在我处办理资产入库手续。
支付环节
按合同规定及财务相关政策予以支付货款。
备案流程（如适用）：
采购预算在1万元（含）以上，学校统一采购限额标准以下的分散采购项目，需在系统备案。
采购完成后须在系统内完成备案，包括购前审批、录入结果、系统备案等步骤。
建议在办理学校自主采购手续时，详细阅读并遵循学校发布的相关政策和流程，确保采购活动的合法性和规范性。同时，保持与相关部门的沟通，确保采购过程的顺利进行。