内蒙古地区的理科生在选择二本大学时，可以考虑以下几所知名院校：
内蒙古医科大学：
这所大学在医学领域有较强实力，设有多个医学相关专业，是内蒙古地区较为知名的二本院校。
内蒙古工业大学：
这所大学在工程、技术等领域有较好的教学和科研能力，提供多个工科专业。
内蒙古科技大学：
这所大学在科技领域有较强实力，涵盖多个学科领域，是内蒙古地区较为知名的二本院校。
内蒙古师范大学：
这所大学在师范教育领域有较强实力，提供多个教育相关专业，是内蒙古地区较为知名的二本院校。
内蒙古财经大学：
这所大学在财经管理领域有较好实力，提供多个财经管理相关专业，是内蒙古地区较为知名的二本院校。
内蒙古农业大学：
这所大学在农林类领域有较强实力，提供多个农林相关专业，是内蒙古地区农林类专业的强校。
内蒙古民族大学：
这所大学在民族教育领域有较强实力，提供多个民族相关专业，是内蒙古地区较为知名的二本院校。
赤峰学院：
这所大学在赤峰地区有较好实力，提供多个学科相关专业，是内蒙古地区较为知名的二本院校。
呼伦贝尔学院：
这所大学在呼伦贝尔地区有较好实力，提供多个学科相关专业，是内蒙古地区较为知名的二本院校。
呼和浩特民族学院：
这所大学在呼和浩特地区有较好实力，提供多个民族相关专业，是内蒙古地区较为知名的二本院校。
河套学院：
这所大学在河套地区有较好实力，提供多个学科相关专业，是内蒙古地区较为知名的二本院校。
内蒙古科技大学包头医学院：
这所大学在包头地区有较好实力，提供多个医学相关专业，是内蒙古地区较为知名的二本院校。
内蒙古师范大学（校企合作和中外合作）：
这所大学在师范教育领域有较强实力，提供多个教育相关专业，且有校企合作和中外合作项目。
内蒙古工业大学（校企合作）：
这所大学在工程、技术等领域有较好实力，提供多个工科专业，且有校企合作项目。
建议理科生在选择大学时，综合考虑自己的兴趣和职业规划，同时参考最新的官方发布信息或咨询当地的教育招生部门以获得最准确的信息。