日本牙医大学排名如下：
东京医科齿科大学：
这所大学是日本最早的公立牙医学教育机构之一，拥有雄厚的科研实力，在齿学和医学上都有很高的评价。在QS世界大学排名中，其齿学部位于日本第一，世界排名前十位。
京都大学：
作为日本顶尖的国立综合大学之一，京都大学医学部的师资和技术水平非常高。
大阪大学：
这是一所综合研究型国立大学，拥有广泛的研究领域和成员资格，在口腔医学教育、临床技能培养、科研成果等方面具有显著优势。
东北大学：
这所著名的国立研究型综合大学拥有多个学科，包括医学部。
东京大学：
虽然东京大学在综合排名中位列日本第一，但在牙科专业排名中并未明确列出其具体位置。
庆应义塾大学：
作为私立大学中的第一名校，庆应义塾大学的师资以及教学力量毋庸置疑，但在牙科专业排名中并未明确列出其具体位置。
九州大学齿学部：
在口腔医学研究领域具有很高的知名度，但在综合排名中并未明确列出其具体位置。
北海道大学：
在牙科专业排名中并未明确列出其具体位置。
综合以上信息， 东京医科齿科大学在牙科专业排名中位居日本第一，世界排名前十位。