现代制药工程专业主要学习以下内容：
基础化学课程
有机化学
无机化学
物理化学
生物化学
化工原理
药学相关课程
药物化学
药理学
药剂学
药物合成反应
天然药物化学
中药学（包括中药化学、中药药剂学、中药制剂分析、中药药理学等）
工程类课程
制药工艺学
制药工程与工艺
药用高分子材料
制药分离工程
制药装备与车间设计
药品生产装置与工艺流程设计
实验技能与工程训练
化学化工实验技能
工业实践
计算机应用
科研与工程设计方法
药物生产装置与工艺流程设计
管理类与法规课程
药事管理学
药品营销
药品法规与环境保护
选修课程
应用光谱解析
药物分析
制药分离工程
药用植物学
农药学
该专业旨在培养具备扎实化学、药学、生物学和工程学基础，能够从事药品研发、制造、质量控制、工艺设计及生产管理的高素质工程技术人才。通过系统的课程学习和实践训练，学生将掌握药物生产的基本原理和工程技术，具备在新药研制、工艺改进及生产管理等方面工作的能力。